TechNestFTP открывает папку на сервере как папку на своём компьютере. Пользователь и пароль совпадают с панелью. Порт 21 и на Linux, и на Windows.
Файл темы, который правите руками, сотрёт следующее обновление. Держите правку в редакторе темы, если можно. Путь к файлам на карточке аккаунта в кабинете.